“血管外膜淋巴网络多维数据平台”是心血管疾病中细胞类型聚类和注释的集成资源。我们收集了10个人类单细胞RNA-seq项目和12个小鼠单细胞RNA-seq项目,分别包括~1537k和~884k细胞。通过大规模的文献检索和人工标注,构建了4个人类、5个小鼠的常见心血管疾病和健康组织的scRNA-seq参考图谱,涵盖15个和18个细胞类型。我们还提供了六个主要的分析模块,允许用户运用scRNA-seq数据探索人类和小鼠心血管疾病发病机制。
“心血管数据平台”是心血管疾病中细胞类型聚类和注释的集成资源。我们收集了10个人类单细胞RNA-seq项目和12个小鼠单细胞RNA-seq项目,分别包括~1537k和~884k细胞。通过大规模的文献检索和人工标注,构建了4个人类、5个小鼠的常见心血管疾病和健康组织的scRNA-seq参考图谱,涵盖15个和18个细胞类型。我们还提供了六个主要的分析模块,允许用户运用scRNA-seq数据探索人类和小鼠心血管疾病发病机制。

网站功能

Website Features
  • 细胞聚类和细胞类型

  • 不同细胞类型标记基因的列表及表达

  • 各细胞类型在细胞周期、 细胞状态和免疫途径 中的功能分配

  • 细胞-细胞通讯及相应的配体-受体相互作用

  • 用于用户上传的单细胞转录组的在线分析工具

  • 细胞类型特异性转录调控的鉴定

数据库情况

Database situation
  • 人类

  • 4

    人类疾病

  • 10

    人类数据集

  • 1537k

    人类细胞数

  • 15

    人类细胞种类

  • 小鼠

  • 5

    小鼠疾病

  • 12

    小鼠数据集

  • 884k

    小鼠细胞数

  • 18

    小鼠细胞种类

平台介绍

Platform Introduction

细胞图谱

  • GEO数据集概况

    scRNA-seq数据集

  • 人类疾病图谱

    细胞类型、T细胞、B细胞

  • 小鼠疾病图谱

    细胞类型、T细胞、B细胞

数据集注释及分析

  • 细胞类型标记

    在线分析、数据上传

  • 细胞类型

    细胞毒性T细胞...

  • 标记基因表达

    浏览细胞种类及下载分析等

  • 调控网络

    浏览细胞种类及下载分析等

网站功能

  • 检索

    通过细胞类型或疾病

  • 浏览

    浏览细胞种类及下载分析等

  • 分析

    在线分析、数据上传